Бұл мақалада заманауи білім беруді модернизациялаудың өзектілігі, атап айтқанда, білім беру мекемелерін басқару саласындағы қызметті реформалау қарастырылады. Білім беру ұйымдарын басқаруды жаңарту білім беру ұйымдарын басқаруда инновациялық тәсілдерді енгізуді көздейді. Қазіргі заманғы білім беру мекемелерінің қызметін сипаттайтын басым бағыттардың бірі оның басқару циклін өзгерту екендігі анықталды. Басқарудың тиімді әдістерінің бірі ретінде қолданыстағы дәстүрлі тік командалық-әкімшілік жүйеден айырмашылығы бар көлденең-циклдік ұйымдық құрылым (КЦҰҚ) қарастырылады. Бұл трансформация өзінің мақсаты ретінде жалпы міндеттерді орындау процесінде тиісті ұйымдық бөлімшелердің (қалыптасқан бөлімдердің) іс-әрекеттерін орталықтандырылмаған үйлестіруді жүзеге асырады. Ұсынылған жұмыс КЦҰҚ-ты енгізу Абай атындағы Қазақ ұлттық педагогикалық университетінің Жаратылыстану және география институты мысалында енгізуді зерттейді.